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Publication Open Access Marktdaten zur Biotechnologie - Produkte und Reaktoren(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1987-09)Aufgrund der hohen Wachstumsraten, die vielfach fiir den Biotechnologiemarkt prognostiziert werden, und gefördert durch das Biotechnologie-Programm der Bundesregierung, in dem die Entwicklung der Bioverfahrenstechnik einen hohen Stellenwert einnimmt, kann man heute beobachten, daß zahlreiche Anlagen- und Apparatebaufirmen erwägen, sich auf dem Gebiet der Biotechnologie zu betätigen und zu investieren, um so langfristig an diesem Markt teilzunehmen. Auch der Verband Deutscher Maschinen- und Anlagenbau eV (VDMA) ist sich der wachsenden Bedeutung der Biotechnologie bewußt und hat 1986 und 1987 Workshops zu diesem Problemkreis organisiert. Allerdings differieren die Erwartungen und Prognosen über den zukünftigen Biotechnologiemarkt außerordentlich stark. Selbst die Erfassung des derzeitigen Marktvolumens ist schwierig. Die Diskrepanzen ergeben sich teilweise durch unklare Definitionen darüber, welche Produkte der Biotechnologie zugeordnet werden. Bei der Abschätzung des Potentials der neuen Biotechnologieprodukte ist besonders deren Markteintritt unsicher. Viele Prognosen sind spekulativ und nicht nachvollziehbar. "Bioprognostik" stellt zur Zeit einen eigenen Markt mit nicht unbeträchtlichem Marktvolumen dar. Nach einem Bericht von N. Rau in BTF-Biotech-Forum 3 (1986) 121 sind über 300 Marktstudien, -analysen und -forschungsberichte über den Bereich der Biotechnologie erhältlich, deren Preis sich aufsummiert auf etwa 2 Mio DM beläuft. Für einzelne Studien sind bis zu 35.000 US $ zu zahlen, Seitenpreise bis zu 100 DM sind keine Seltenheit. Die Vielzahl der Prognosen allein schon verdeutlicht die Verwirrung. Mit der Herausgabe dieses Hefts bemüht sich die GBF, die Diskussion zu versachlichen, indem in Teil I - selbstverständlich ohne Anspruch auf Vollständigkeit - Daten aus Marktstudien und Analysen zusammengestellt wurden, auf deren Basis einige, wie wir meinen, konservative Schlußfolgerungen über den erwarteten Bioboom gezogen werden können. Im Teil II der vorliegenden Studie wird nur der Bioreaktormarkt betrachtet, da viele Anlagen- und Apparatebauer, besonders die, die für die Pharma-, Lebens- und Genußmittelindustrie tätig sind, hier einen günstigen Einstieg in einen lukrativen Markt vermuten.Publication Open Access Das Gensequenzanalysesystem DIANA(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)DIANA (Dna Interactive Artificial Neural-network Analysis) is a software package for the analysis of gene sequences. It allows a precise determination of splicing positions and coding regions in the human genom. The method is based on cascading neural networks, which were specially trained for the identification of human genes. DIANA has got a graphical user interface that is easy to understand. The analysis of 100.000 base pairs takes only a few seconds on a standard workstation. DIANAcanbe extendedfor further organisms.Publication Open Access An Integrated Services Approach to Biological Sequence Databases(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)Database users in molecular biology are faced with steadily increasing amounts of raw data, multiple database providers and services. Here we describe the integration of a set of previously isolated database services and demonstrate their accessibility through a uniform userinterface. A multi-layered software architecture is applied to make different degrees of service integration transparent to the user. We focus on the design of specialized gateways that integrate services differing in temporal behavior and stateless or state dependent operation. Gateways may reside on heterogeneousplatforms. A link layeris introducedto integrate individual query functions in order to interrelate simple, complex and state dependent services through a common, unique interface. It is possible to generate new complex services by a combination of multiple functions. Wedescribe the application of the World Wide Web (WWW)as the implementation framework of the interface layer. To assure interoperability of services, integrity of data resources must be supervised. Consistency control is issued by a dedicated synchronization layer.Publication Open Access 3D-Segmentierungstechniken und vektorwertige Bewertungsfunktionen für symbolisches Protein-Protein-Docking(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)The growing number of known 3D protein structures asks for computing systems predicting whether and where two molecules interact with each other. This requires search for possible docking sites of proteins. Based on results of preprocessing techniques like computation of molecular surfaces and segmentation, a knowledge based control algorithm implemented with the semantic network ERNEST searches for geometrical and chemical complementarity on molecular surfaces, computes coarse docking positions considering steric clash and simple geometric judgement functions. Additionally, ERNEST guides a more detailed analysis of finer calcultations including correlation of geometry and hydrophobicity. The proposed hierarchical system allows to predict completely automatically and in reasonable short computing times possible docking sites for two given proteins. A set of 18 representative examples is discussed.Publication Open Access Algebraic Methods for the Analysis of Redundancy and Identifiability in Metabolic 13C-Labelling Systems(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)Stationary !?C tracer experiments supply a large amount of information related to metabolic fluxes in microorganisms. The unknownintracellular fluxes can be determined from some directly measured metabolic fluxes and the fractional labelling of intracellular carbon atom pools. Metabolic ?C-Labelling Systems are modelled by large algebraic equation systems with respect to fluxes and fractional labels. Identifiability of the unknownintracellular fluxes and redundancy of measured quantities are of great importance for the design and evaluation of experiments. This contribution presents algebraic methods to treat these problemsa priori and a posteriori. The Gröbnerbasis algorithm from polynomialideal theory is shownto be capable of solving all relevant problems. Ideas from algebraic geometry prove to be helpful in designing corresponding computer algebraic solution strategies. As an application example some global results on the identifiability of bidirectional reaction steps are derived.
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