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Publication Open Access Marktdaten zur Biotechnologie - Produkte und Reaktoren(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1987-09)Aufgrund der hohen Wachstumsraten, die vielfach fiir den Biotechnologiemarkt prognostiziert werden, und gefördert durch das Biotechnologie-Programm der Bundesregierung, in dem die Entwicklung der Bioverfahrenstechnik einen hohen Stellenwert einnimmt, kann man heute beobachten, daß zahlreiche Anlagen- und Apparatebaufirmen erwägen, sich auf dem Gebiet der Biotechnologie zu betätigen und zu investieren, um so langfristig an diesem Markt teilzunehmen. Auch der Verband Deutscher Maschinen- und Anlagenbau eV (VDMA) ist sich der wachsenden Bedeutung der Biotechnologie bewußt und hat 1986 und 1987 Workshops zu diesem Problemkreis organisiert. Allerdings differieren die Erwartungen und Prognosen über den zukünftigen Biotechnologiemarkt außerordentlich stark. Selbst die Erfassung des derzeitigen Marktvolumens ist schwierig. Die Diskrepanzen ergeben sich teilweise durch unklare Definitionen darüber, welche Produkte der Biotechnologie zugeordnet werden. Bei der Abschätzung des Potentials der neuen Biotechnologieprodukte ist besonders deren Markteintritt unsicher. Viele Prognosen sind spekulativ und nicht nachvollziehbar. "Bioprognostik" stellt zur Zeit einen eigenen Markt mit nicht unbeträchtlichem Marktvolumen dar. Nach einem Bericht von N. Rau in BTF-Biotech-Forum 3 (1986) 121 sind über 300 Marktstudien, -analysen und -forschungsberichte über den Bereich der Biotechnologie erhältlich, deren Preis sich aufsummiert auf etwa 2 Mio DM beläuft. Für einzelne Studien sind bis zu 35.000 US $ zu zahlen, Seitenpreise bis zu 100 DM sind keine Seltenheit. Die Vielzahl der Prognosen allein schon verdeutlicht die Verwirrung. Mit der Herausgabe dieses Hefts bemüht sich die GBF, die Diskussion zu versachlichen, indem in Teil I - selbstverständlich ohne Anspruch auf Vollständigkeit - Daten aus Marktstudien und Analysen zusammengestellt wurden, auf deren Basis einige, wie wir meinen, konservative Schlußfolgerungen über den erwarteten Bioboom gezogen werden können. Im Teil II der vorliegenden Studie wird nur der Bioreaktormarkt betrachtet, da viele Anlagen- und Apparatebauer, besonders die, die für die Pharma-, Lebens- und Genußmittelindustrie tätig sind, hier einen günstigen Einstieg in einen lukrativen Markt vermuten.Publication Open Access Data set heterogeneities and their effects on the derivation of contact potentials(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)A new class of protein structure prediction methods bases on threading a sequence through a known 3D structure. These techniques offer a means of recognizing similarity in cases of distant evolutionary relationship, where the fold has been conserved to a greater extent than its sequence. The scoring table(s) which are used to evaluate different sequence to structure alignments are derived from a particular database of known structures. The distribution and the reliability of the threading scores is effected by parameters of this database, such as length and composition of the included chains, and the number of alternative alignments. Weinvestigated several compositional aspects of two databases which were used in protein fold recognition studies. Among them are the numberof chains from different folding classes, the amino acid distribution within the classes, and the sequence lengths.Publication Open Access Force Field Minimization: Domain Decomposition, Positive Definite Functions, and Wavelets(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)In force field calculations the 3D-structure of macromolecules is computed by minimization of the total internal energy. The large numberof degrees of freedom causes numerical problems in the optimization procedure evenfor relatively small molecules. The number of free variables is reduced by a domain decomposition method assembling certain groups of atoms into configurational structures with considerably less degrees of freedom. To reduce the amount of computations necessary for a prescribed accuracy, approximations to the energy function with respect to these variables are constructed using methods from the theory of splines, wavelets, and positive definite functions.Publication Open Access Simulation and Animation of Intracellular Diffusion(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)A computer program was created which allowed for the calculation and animation of intracellular diffusion of molecules which diffused from the external space of tissue into the internal space where they were distributed. Time and spatial distribution of the molecule concentration could be displayed on a PC screen. The program wasused for the interpretation of lidocaine effects on the sodium channels of the membraneof spinal sensory ganglioncells.Publication Open Access Statistical Analysis of DNA Sequences(GBF Gesellschaft für Biotechnologische Forschung mbH, Braunschweig, 1995)Wereport recent results of statistical analysis of DNA sequencesin this paper. First, we show howrepetitive segments reduce the information content measured by Shannon entropies. Then, the effect of a nonuniform codon usage on the mutual information function is studied analytically. For this purpose, the concept of pseudo-exons is introduced. Finally, we discuss the modularity of DNA which can serve as a sensitive tool to distinguish DNA sequences from randomstrings.
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